Отдел мониторинга окружающей среды сотрудничает с более чем 30 научными и научно-производственными организациями. Среди них:
- Республиканское унитарное предприятие «Научно-производственный центр по геологии»;
- Республиканское унитарное предприятие «Центральный научно-исследовательский институт комплексного использования водных ресурсов»;
- Учреждение образования «Белорусский государственный университет» (географический факультет, научно-исследовательский центр мониторинга озоносферы);
- Республиканское унитарное предприятие «Институт почвоведения и агрохимии» Национальной академии наук Беларуси» (РУП «ИПА НАН Беларуси»);
- Учреждение образования «Белорусский национальный технический университет»;
- РУП «Проектный институт Белгипрозем»;
- Национальное кадастровое агентство;
- Государственное научное учреждение «Институт природопользования НАН Беларуси»;
- Государственное научное учреждение «Институт экспериментальной ботаники им. В. Ф. Купревича НАН Беларуси» (ИЭБ НАН Беларуси);
- Государственное научно-производственное объединение «Научно-практический центр НАН Беларуси по биоресурсам» (ГНПО «НПЦ НАН Беларуси по биоресурсам»);
- Государственное научное учреждение «Институт леса НАН Беларуси»;
- Государственное учреждение «Центр геофизического мониторинга НАН Беларуси»;
- Государственное учреждение «Республиканский центр радиационного контроля и мониторинга окружающей среды» департамента по гидрометеорологии Минприроды (РЦРКМ) (реорганизовано);
- Государственное учреждение «Республиканский гидрометеорологический центр» (реорганизовано);
- Государственное учреждение «Республиканский центр по гидрометеорологии, контролю радиоактивного загрязнения и мониторингу окружающей среды»;
- Республиканское унитарное предприятие «Информационный центр земельно-кадастровых данных и мониторинга земель» (реорганизовано);
- Республиканское унитарное предприятие «Белорусский научно-исследовательский геологоразведочный институт» (Бел НИГРИ) (реорганизовано);
- Центральная гидрогеологическая партия Белорусской гидрогеологической экспедиции (реорганизовано);
- ЛРУП «Белгослес»;
- Государственное учреждение по защите и мониторингу леса «Беллесозащита»;
- Республиканское унитарное предприятие «Белгосохота»;
- Полесский государственный радиационно-экологический заповедник;
- Республиканский центр гигиены, эпидемиологии и общественного здоровья Министерства здравоохранения Республики Беларусь;
- Государственное учреждение «Республиканский центр управления и реагирования на чрезвычайные ситуации» Министерства по чрезвычайным ситуациям Республики Беларусь.
В число организаций, с которыми мы сотрудничаем, входят также международные научные учреждения: Берлинский университеты им. А. Гумбольдта, Кильский университет им. Альбрехта, институт аграрного развития в странах Центральной и Восточной Европы (г. Халле).